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机器人劳动力克服遗传病

发布时间:2017-06-02 08:43:16来源:未知点击:

在加利福尼亚州山景城的彼得·奥尔德胡斯(Peter Aldhous),我穿过一个内部窗户,进入一个装满高科技机器的令人毛骨悚然的蓝色房间内部温度保持在28°C,湿度很高技术人员扫描计算机屏幕以确保机器人很高兴,但似乎对我的存在一无所知将蓝色灯替换为绿色,它将类似于星际迷航的Borg立方体之一的内部值得庆幸的是,技术人员看起来并不像机器人,目标不是人类的同化相反,这是加利福尼亚州山景城的初创企业Complete Genomics的生产线,投注将彻底改变疾病基因的发现它已经是世界上最大的人类基因组测序工厂在一个网球场大小一半的房间里,有16个机器人,去年对800人的基因组进行了测序全力以赴,他们现在可以每月生产400个基因组向研究人员和制药公司提供但尚未向私人提供的当前价格为每个基因组9500美元;下订单1000或以上,降至5500美元当您考虑到十年前第一个人类基因组已经完成数十亿次时,DNA测序已经走过了漫长的道路在我调查现场时,公司营销主管Jennifer Turcotte解释了为什么它与其他测序实验室不同 DNA通常在密封的机器内部读取,但是这里机器人的暴露是为了便于维护热量和湿度适合测序反应的生物化学,昏暗的蓝光避免了漂白用于检测遗传密码的每个字母的荧光探针的频率技术人员穿着洁净室装备,因为灰尘会干扰读取序列除非出现问题,否则他们无需干预机器人添加所需的试剂,并操纵样品,以便相机可以记录一次显示70个碱基的DNA序列的光信号将这些片段组装成30亿个碱基对人类基因组所需的强大计算是在距离圣克拉拉约20分钟车程的全自动数据中心完成的 - 那里的电费更便宜,数据存储按千瓦时收费该公司首席执行官克利福德•里德(Clifford Reid)解释道由于生产线基本上自行运行,185名员工中的大多数都在忙于改进公司的测序技术,或与客户联络 “我们需要人们与人们互动,但不要与DNA互动,”里德说在一个可爱的扭曲,该公司甚至自动化其接待区当我到达时,我受到了一个电脑终端的欢迎,它询问了我的名字和我来看的人一个标签打印机吐出一个访客徽章,而一封电子邮件召唤Turcotte引导我进入内部密室自动化文化具有严肃的科学目标遗传学家曾希望确定我们对疾病易感性的突变会从有限的扫描中出现,这种扫描记录了基因组中约100万个位置的常见变异但到目前为止,这些发现解释了许多条件遗传性的一小部分基因猎人开始闯入墙壁寻找缺失的突变意味着对整个基因组进行测序并精确定位与该疾病遗传的罕见异常去年由西雅图系统生物学研究所的Leroy Hood领导的研究小组展示了这一原则,该研究小组将一个受影响家庭的颅面疾病Miller综合征的突变范围缩小到四个(Science,DOI:10.1126 / science) 0.1186802)完整的基因组学进行了测序几家公司正在推动DNA测序的成本和速度但是,完全基因组学在将其技术定制为生产全人类基因组的任务,并决定不出售机器而是提供合同排序服务方面是不同寻常的 Hood认为科学家在做这项工作时没什么意义:“我们希望努力开发解释信息的工具”Hood坐在Complete Genomics的科学顾问委员会上,但该公司也赢得了没有个人对其成功的兴趣它们包括美国国家癌症研究所,它正在比较来自同一个体的正常细胞和癌细胞的序列,以寻找儿童癌症背后的突变对于引起疾病的突变,抗药性是徒劳的吗观看此空间......有关这些主题的更多信息: